En este caso los fungicidas se aplican a los cultivos anuales, frutales y bayas con el fin de controlar las enfermedades de transmisión aérea. Prácticamente todos los grupos de fungicidas se aplican con este fin. Los más frecuentes son los compuestos de cobre, los ditiocarbamatos, los derivados nitrogenados aromáticos, las quinonas, las ftalimidas, las guanidinas y los hidrocarburos clorados, así como algunos compuestos heterocíclicos y de níquel y ciertos antibióticos.
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